якщо двократне збільшення (зміна кратності=2, Log2FC=1) між A і B, тоді A вдвічі більше за B (або A становить 200% від B). Якщо між A і B спостерігається подвійне зменшення (зміна кратності = 0,5, Log2FC= -1), то A вдвічі менше за B (або B вдвічі більше за A, або A становить 50% від B). 11 жовт. 2018 р
Зміну log2 можна розрахувати за такою формулою: log2(кратна зміна) = log2(значення виразу в умові A) – log2(значення виразу в умові B) де умова A та умова B є двома різними умовами, які порівнюються.
Зміна кратності описує співвідношення двох значень, напр. (експресія гена в умові 1)/(експресія гена в умові 2). Якщо вираз був удвічі вищим в умові 1, ніж в умові 2, відбувається кратна зміна в 2. З іншого боку, якби було навпаки, було б зменшення в 1/2 разу.
Щоб обчислити зміну кратності, розділити кінцеве значення на початкове. Результатом є співвідношення, яке представляє коефіцієнт, на який початкове значення збільшилося або зменшилося, щоб досягти кінцевого значення.
По-перше, ви повинні розділити FPKM другого значення (другої групи) на FPKM першого значення, щоб отримати Fold Change (FC). потім помістіть рівняння в Excel =Log(FC, 2) щоб отримати значення log2-кратної зміни зі значення FPKM.
Складні зміни в геноміці та біоінформатиці Логарифм за основою 2 використовується найчастіше, оскільки його легко інтерпретувати, напр. подвоєння в початковому масштабуванні дорівнює зміні в 2 рази в 1, почетверення дорівнює log2-кратній зміні в 2 і так далі.