Його дизайн натхненний Могольська, османська та перська архітектура. Велика мечеть Шейха Заїда є найкращим зразком ісламського мистецтва, що поєднує в собі архітектуру Моголів, мавританську, османську та перську. Результат – захоплююче поєднання традицій і сучасності, споруда, яка вшановує минуле та дивиться в майбутнє.
Велика мечеть шейха Заїда є однією з найбільших мечетей у світі та величезним архітектурним витвором мистецтва, який навмисно поєднує різні ісламські архітектурні школи. Це особливості 82 куполи, понад 1000 колон, позолочені люстри з 24-каратного золота та найбільший у світі килим ручного в’язання.
Для проектування та будівництва було обрано природні матеріали, в тому числі завдяки їх довговічності мармур, золото, напівдорогоцінне каміння, кристали та кераміка.
Місячна система освітлення мечеті була унікальний дизайн, щоб відображати місячний цикл, спроектований на зовнішні поверхні мечеті а освітлення змінюється інтенсивністю та яскравістю протягом місяця хіджри відповідно до положення та фази місяця.
Хоча сама мечеть зазнала багатьох архітектурних змін, будівля по суті залишилася відкритий простір, як правило, накритий дахом, що містить міхраб і мінбар, з мінаретом, який іноді прикріплюється до нього.