Тільки вектори ДНК можна використовувати для стабільної трансфекції; Сама по собі РНК не може бути стабільно введена в клітини. Велика кількість копій трансфікованого генетичного матеріалу призводить до високого рівня експресії білка. Одна чи низька кількість копій стабільно інтегрованої ДНК призводить до нижчого рівня експресії білка.
Як правило, стабільна трансфекція передбачає інтеграція трансфікованої ДНК у геном клітини-господаря, що дозволяє трансфікованим клітинам передавати цю ДНК своєму потомству. Іноді стабільна трансфекція може відбуватися через успадкування негеномної ДНК.
Лентивірусні вектори (LV) є чудовими інструментами для перенесення генів, як in vivo, так і in vitro, завдяки їхній здатності назавжди інтегруватися в геном клітини, що ділиться та не ділиться, підтримуючи тривалий стабільний вираз.
Перехідні та стабільні векторні трансфекції зіграли важливу роль в ілюстрації функції конкретних генів/білків. Загальне припущення полягає в тому, що така платформа може ефективно зв’язувати певний ген/білок із отриманими фенотипами, розкриваючи механізм роботи гена.
ДНК-плазміди, що містять рекомбінантні гени та регуляторні елементи можна трансфікувати в клітини для вивчення функції та регуляції генів, мутаційного аналізу та біохімічної характеристики генних продуктів, а також впливу експресії генів на здоров’я та життєвий цикл клітин.
Стабільна трансфекція встановлює тривалі генетичні зміни в клітинах, інтегруючи чужорідну ДНК у геном хазяїна, забезпечуючи послідовну експресію генів з часом. І навпаки, тимчасова трансфекція вводить генетичний матеріал без постійної інтеграції, що призводить до короткочасної експресії генів.