збірка геному – це стратегія збирання геному, представлення геномної збірки нового геному з нуля без допомоги еталонних геномних даних. Збірки геному de novo не передбачають попереднього знання про довжину, структуру або склад вихідної послідовності ДНК.
Засоби синтезу de novo мікробна ферментація складних субстратів (цукрів і споріднених субстратів) і утворення бажаних молекул. Ароматичні сполуки мікробного походження, отримані шляхом синтезу de novo, включали терпени, складні ефіри, альдегіди та спирти.
Збірка геному відноситься до процесу розміщення послідовності нуклеотидів у правильному порядку. Потрібна збірка, оскільки довжина зчитування послідовності – принаймні на даний момент – набагато коротша, ніж у більшості геномів або навіть у більшості генів.
De novo секвенування відноситься до секвенування нового геному, де немає контрольної послідовності, доступної для вирівнювання. Зчитування послідовностей збираються як контиги, і якість охоплення даних послідовності de novo залежить від розміру та безперервності контигів (тобто кількості прогалин у даних).
Основна перевага секвенування de novo полягає в тому не вимагає довідкової бази даних для виведення повнорозмірних або часткових пептидних послідовностей на основі міток безпосередньо з експериментальних тандемних мас-спектрометричних спектрів.
Шлях біосинтезу нуклеотидів de novo дуже консервативний і важливий біохімічний шлях майже в усіх організмах. Як пуринові нуклеотиди, так і піримідинові нуклеотиди необхідні для клітинного метаболізму та проліферації.