Сама перуанська Амазонка утворює біогеографічний регіон, що складається з біом тропічного лісу, типовою рослинністю якого є густий вічнозелений широколистий ліс, а клімат — вологий тропічний.
Географічне положення та умови навколишнього середовища Перу надають йому велике багатство екосистем. У Перу ми можемо знайти моря, пустелі, гірські степи, болота, гори та льодовики, джунглі та ліси різних типів, савани, серед інших екосистем та транзакційних зон.
Вважається а наземний біом високої біологічної щільності і відноситься до міжтропічної зони конвергенції, причому число видів також більше. В Америці він поширюється до Мексики, а в Африці до Мадагаскару.
Прибережні водно-болотні угіддя Перу охоплюють такі різноманітні екосистеми, як лагуни, прибережні лагуни, мангрові зарості, оазиси, прибережні солончаки, дельти та естуарії і вони знайдені розкиданими по всьому узбережжю між Тумбесом і Такною.
Є екосистеми водні, наземні, змішані та штучні. Крім того, залежно від способу їх вивчення ми можемо знайти різні способи їх класифікації.