Найважливішими бактеріальними видами, які виділяють із забрудненого нафтою ґрунту та підтвердили біодеградацію нафти, є Acinetobacter sp., Flavobacterium, Bacillus sp., Aeromonas sp., Micrococcus sp., Staphylococcus sp., Vibrio Xanthomonas і Pseudomonas sp.
Ці бактерії відомі як бактерії, що розкладають вуглеводні. Pseudomonas може перетравлювати вуглеводні в нафті. Це грамнегативні бактерії, які знаходяться в ґрунті, воді, рослинах і тваринах. Вид наз Pseudomonas putida широко використовується для дезактивації розливів нафти або біоремедіації.
Останні дослідження виявили бактерії з понад 79 родів, які здатні розкладати нафтові вуглеводні (Tremblay et al., 2017); деякі з цих бактерій, такі як Achromobacter, Acinetobacter, Alkanindiges, Alteromonas, Arthrobacter, Burkholderia, Dietzia, Enterobacter, Kocuria, Marinobacter, …
Існують види морських бактерій у кількох родинах, у тому числі Marinobacter, Oceanospiralles, Pseudomonas і Alkanivorax, які можуть їсти сполуки з нафти як частину свого раціону. Насправді існує щонайменше сім видів бактерій, які можуть виживати виключно на нафті [1].
Серед різноманітної мікробної популяції, пов’язаної з деградацією полімеру, Бацила, синьогнійна паличка, родокок і стафілокок є поширеними родами бактерій. Подібним чином Aspergillus і Penicillium є домінуючими родами грибів.
Вони відомі як гідрокарбонокластичні бактерії (ГХБ).